体調が悪く休職することになりました。
休職すると出勤率が8割を下回り、来年の年次有給休暇が出なくなるのではと不安です。
休職後、職場へ復帰した後も通院する必要があるため、来年の年次有給休暇が出ないと困ってしまいます。

休職期間中の扱いは、会社によって異なります。
休職期間に関する年次有給休暇の出勤率については、通常、休職期間も全労働日に含めた上で欠勤扱いとする場合が多いようですが、まずは会社側に確認を行ってみましょう。