ごく少数の社員で運営されている零細企業でも、社員は年次有給休暇を
もらうことができるのでしょうか?

年次有給休暇は、労働者の権利です。
零細企業でも大企業でも、等しく年次有給休暇を得る権利があります。

また企業は、人を雇用している場合、年次有給休暇の取得や残業手当の支給、
社会保険や労働保険(労災・雇用)への加入は避けられないコストであると
認識しなければなりません。