年次有給休暇の申請を提出した社員が、「その日に予定していた用事が延期に
なったため、出勤したい。年次有給休暇の申請を取り消したい」と申し出た
場合、会社側(使用者)はどのようにすればいいのでしょうか?

年次有給休暇の申請を取り消したい、という申し出は、必ず認めなければ
ならないものではありません。

申請者の年次有給休暇の取得を認める為には、会社側は、正常な業務の運営
を行う為に代替勤務者の確保や勤務割を変更する努力を行う必要があります。

既に認められた年次有給休暇の申請を取り消すことによって、業務の正常な
運営を妨げる場合には、申し出を断ることができます。

また、社員の申し出を認めることは問題ありません。