交通事故に遭遇し入院を行った際に、年次有給休暇を取得した場合、
休業損害を請求することはできるのでしょうか?

年次有給休暇についても、休業損害を請求する事ができます。

休業損害は下記の計算式で計算を行います。

休業損害=(基礎収入)×(休業日数(有給休暇を含む))

基礎収入=(事故前3か月の基本給+付加給)÷90