「年次有給休暇中の賃金に関する協定」、
「年次有給休暇の計画的付与に関する協定」、
「時間単位年休に関する協定、といったような、年次有給休暇に関する
労使協定文章、帳簿の保存期間はどのくらいなのでしょうか。

年次有給休暇に関する労使協定文章の保存期間は、完結の日(有効期間の満了日)
から3年間とされています。

参考:ヒューマンテラス株式会社有用資料人事労務・組織関連の文書・帳簿の保存期間一覧表